《机密武装》的故事发生在近未来，讲述军方用来训练士兵与外星人对抗的战斗模拟系统突然出现严重病毒，导致各种具有攻击性的程序在虚拟网络空间流窜。更加严重的是，军方竟然已经无法关闭该系统。于是他们只能召集全球最强大的黑客，集合他们的力量进入虚拟世界中消灭病毒。玩家扮演的就是进入了虚拟世界的武装黑客，找出战略系统失控的真正原因。
本作的前提设定类似于另一看著名FPS游戏《电子世界争霸战2.0》，游戏中出现的敌人包括BUG、外星人的恶意代码以及系统本身的安全代码。本作中共有30多种武器可以使用，并且可以通过强化能量提升武器性能。模拟摇杆用来操作移动右边的四个键用来瞄准，在菜单中也可以对按键进行设定。本作支持
