《编码灵魂：被继承的理想》是由制作《真·女神转生》的岡田耕始操刀的一款RPG类型游戏。虽然是RPG，但战斗中包含了大量的动作成分，玩家不但要根据战斗需要，有针对的进行培养怪兽，而且在战斗中也不可因为怪兽的能力较强就掉以轻心！
本作讲述了游戏主人公JAY的异世界之旅。当时人们在百慕大海域发现了一个谜样的石柱，这些石柱被称为“巨门”，这个“巨门”是现实世界连接异世界[IDEA]的唯一通道。于是军方便对其展开了调查，与此同时，“巨门”也开始暴走！唯一拥有开启“巨门”能力的少年GAIL的护理小姐MAY被卷入异世界，游戏主人公为了救回MAY而展开惊险的异世界之旅，故事由此展开……
遭遇异世界怪物！JAY因现实世界的兵器对异世界怪物无效而陷入危机之中。GAIL给了他有效的武器，两人虽然矛盾重重但是为了救MAY而握手言和。GAIL给JAY的武器能够将异世界的怪物编码化，从而有效地制敌！
在探索的过程中，JAY遇到了困在异世界的谜一般的老人。老人把一本记载着异世界事情的书给了JAY。
